玻璃鋼化糞池的發(fā)酵過程分為：過濾沉淀-厭氧發(fā)酵-固體物分解-糞液排放。
一般來說，我們把一個大的玻璃鋼化糞池池子分成三格或四格，三格叫三級化糞池，四格叫四級化糞池。
污水首先由進水口排到第一格，在第一格里比重較大的固體物及寄生蟲卵等物沉淀下來，開始初步的發(fā)酵分解，玻璃鋼化糞池在上層糞皮和下層糞渣中含細菌和寄生蟲卵最多，中層含蟲卵最少，初步發(fā)酵的中層糞液經(jīng)過糞管溢流至第二池，而將大部分未經(jīng)充分發(fā)酵的糞皮和糞渣阻留在第一池內繼續(xù)發(fā)酵。流入第二他的糞液進一步發(fā)酵分解，蟲卵繼續(xù)下沉，病原體逐漸死亡，糞液得到進一步無害化，產(chǎn)生的糞皮和糞厚度比第一池顯著減少。經(jīng)第一格處理過的污水可分為三層：糊狀糞皮、比較澄清的糞液、和固體狀的糞渣。
經(jīng)過初步分解的糞液流入第二格，而漂浮在上面的糞皮和沉積在下面的糞渣則留在第一格繼續(xù)發(fā)酵。在第二格中，糞液繼續(xù)發(fā)酵分解，蟲卵繼續(xù)下沉，病原體逐漸死亡，糞液得到進一步無害化，產(chǎn)生的糞皮和糞渣厚度比第一格顯著減少。
流人第三格的糞液一般已經(jīng)腐熟，其中病菌和寄生蟲卵已基本殺滅。第三格功能主要起暫時儲存已基本無害的糞液作用。